Ce sont des bactéries naturellement présentes dans le microbiome du nourrisson allaité par sa mère. Les bifidobactéries sécrètent des macromolécules complexes bénéfiques pour la santé humaine. Ces macromolécules régulent le passage de bactéries du microbiome de l’intestin vers le milieu intérieur. Ce phénomène physiologique nous aide à exercer une vigilance quotidienne vis-à-vis de bactéries et de virus de l’environnement (transmission féco-orale) mais également vis-à-vis de bactéries indésirables que nous hébergeons. Or le microbiome évolue tout au long de la vie au détriment des bifidobactéries. Les bactéries opportunistes affluent de plus en plus vers des organes d'où les cellules de l'immunité ne peuvent les déloger aisément. Les attaques du système immunitaire provoquent une inflammation chronique qui favorise l’émergence de pathologies (infections, douleurs articulaires…).